La notion de « cours d’eau présentant un fonctionnement atypique » n’est pas établie. Il est à craindre que cette imprécision soit à l’origine d’une remise en cause de la règle générale pour des ouvrages construits sur des cours d’eau présentant plus ou moins de caractéristiques atypiques. Ces singularités pourraient être abusivement évoquées pour justifier la non-pertinence de la fixation d’un débit minimal suivant les modalités prévues, au détriment de la faune piscicole. En outre, elle risque de se traduire par des contentieux fréquents.