Dans les régions qui comptent plusieurs départements, le préfet de Région peut être la personne appropriée pour coordonner les schémas régionaux de développement de l’aquaculture marine.

Dans les régions monodépartemental d’outre mer, le Conseil régional, en charge à la fois pour partie de la pêche et de l’élevage marin, de la formation professionnelle et du développement économique, est l’institution la plus idoine pour cette mission.