Dans le projet de loi actuel, le conseil d’administration (CA) est composé de 39 membres, ce qui est beaucoup trop pour être opérationnel. Par ailleurs, sa composition reflète davantage un conseil des parties prenantes qu’un conseil d’administration d’un établissement public. Ainsi, il est proposé de resserrer la composition du CA à quinze membres et de créer un conseil des parties prenantes en parallèle pour garantir le dialogue avec les parties prenantes. Pour éviter les doublons, il est proposé que le Comité national de la biodiversité joue ce rôle de conseil des parties prenantes de l’agence en lui affectant en ce sens des prérogatives particulières tel que l’avis sur le programme opérationnel de l’agence et les décisions financières qui pourront y être associées.